Dalam lima tahun terakhir jumlah murid terus meningkat, demikian pula prestasi siswa yang lulus dalam Ujian Nasional cukup menggembirakan.
Beberapa prestasi yang diraih MI Muhammadiyah 01 Watukebo antara lain :
- Juara I putri Ikatan Pencak Silat Indonesia tingkat Kab. Jember Tahun 2010
- Juara II putri Ikatan Pencak Silat Indonesia tingkat Kab. Jember Tahun 2010
- Juara II putra Ikatan Pencak Silat Indonesia tingkat Kab. Jember Tahun 2010
- Juara I putra Tapak Suci Kab. Jember Tahun 2010
- Juara I putri Tapak Suci Kab. Jember Tahun 2010
- Juara umum Tapak Suci tingkat Kec. Ambulu Tahun 2010
- Juara 1 putra IPSI tingkat Kec. Ambulu Tahun 2010
- Juara II Olimpiade Matematika tingkat Kab. Jember Tahun 2009
- Juara II Cerdas Cermat tingkat Kec. Ambulu dan Kec. Tempurejo Tahun 2010
- Juara I Lomba Pidato tingkat Kec. Ambulu Tahun 2009
- Juara I Try Out tingkat Kec. Ambulu Tahun 2010
- Juara II putra ISMUBA tingkat Kab. Jember Tahun 2009
- Juara II putri ISMUBA tingkat Kab. Jember Tahun 2009
- Juara II Pidato tingkat Kab. Jember Tahun 2009
- Juara I putri Tartil tingkat Kab. Jember Tahun 2009
- Juara I putra Tartil tingkat Kab. Jember Tahun 2009
- Juara II lomba Nasyid Bahana Muharam Masjid Al-Baitul Amin Tingkat Kab. Jember Tahun 2010
- Juara III lomba Nasyid Bahana Muharam Masjid Al-Baitul Amin Tingkat Kab. Jember Tahun 2010
- Juara harapan II lomba Adzan tingkat Kab. Jember Tahun 2010
- Juara I putra (3 Kategori) Kejurcab Tapak Suci Kec. Ambulu – Tempurejo Tahun 2010
- Juara I putri (1 Kategori) Kejurcab Tapak Suci Kec. Ambulu – Tempurejo Tahun 2010
- Juara II putra (4 Kategori) Kejurcab Tapak Suci Kec. Ambulu – Tempurejo Tahun 2010
- Juara I Olimpiade Matematika Primagama Mencari Juara Kec. Ambulu Tahun 2012
- Juara II Olimpiade Matematika Primagama Mencari Juara Kab. Jember Tahun 2012
- Juara II Olimpiade MIPA MTsN Umbulsari Tingkat Kabupaten Jember Tahun 2012
- Juara Lomba Futsal IPM Cabang Watukebo - Tempurejo Tahun 2012
- Juara I Olimpiade Matematika MTsN 2 Jember tingkat Kabupaten Jember Tahun 2012
